Metal Gear Solid Rising: Revengeance are loc la trei ani după Guns of the Patriots. Războiul nu mai este o afacere pentru PMCs, sau cel puțin asta spune lumea.

Cu toate acestea, noua tehnologie Cyborg care se scurge din SUA răstoarnă echilibrul și violența sfâșie din nou pacea fragilă. Soldatul Cyborg Raiden trebuie să facă față celui mai puternic inamic al său de până acum.

Atacurile de la armata de cyborgi a Desperado Enforcements declanșează confruntarea, iar în timpul bătăliei, Raiden își pierde ochiul stâng și mâna stângă.

• Au trecut trei ani de la prăbușirea sistemului Patriots, care controlează în secret echilibrul global al puterilor din umbră. Cu toate acestea, pacea rămâne evazivă.
• Răspândirea tehnologiei cibernetice a provocat instabilitate și conflicte, pe măsură ce cei care controlează comerțul obțin din ce în ce mai multă putere.
• Marii "Armate Private", sau PMCs, care erau susținute și controlate de Patriots, s-au prăbușit, lăsând loc nenumăratelor facțiuni paria provenite din organisme mai mari.

• Cu o armură reînnoită și părți Cyborg mai puternice, Raiden atacă teritoriile inamicilor pentru a lupta împotriva Desperado și pentru a-și răzbuna onoarea.
• Desperado a ocupat Abhazia. Compania lui Raiden, Maverick, primește o misiune din Rusia pentru a recupera țara.
• Acești rebeli PMCs, folosind tehnologia Cyborg, devin din ce în ce mai subversivi, schimbând politica și puterea după bunul plac.