În modelul propus de Freud în "Dincolo de principiul plăcerii" pentru geneza ego-ului, se vorbește despre evoluția unei "cisti organice", astfel că se ridică întrebarea dacă el înțelege această evoluție a cistii organice ca pe un organism simplificat, care "își construiește limitele, sistemul perceptiv și cel antistimulator sub influența stimulilor externi". Sau dacă "cista" despre care vorbește Freud este un fel de suflet material*, pe care îl compară cu imaginea biologică a protozoarului;

Și imediat se ridică întrebarea ce sunt arhetipurile, pentru semnificația cărora există o multitudine de neînțelegeri. O modalitate de a le înțelege este de a le compara cu instinctele: Acestea din urmă sunt "împingeri biologice, percepute de simțuri". Astfel, arhetipurile sunt instinctele sufletului, care se manifestă într-un mod necunoscut în imaginație și creează imagini simbolice imateriale. Arhetipul este tema, ideea sa centrală, care apare în diferitele mituri cu imagini diferite.

Ipoteza lui Edelman și Tononi privind structura nucleului dinamic: a. Unele grupuri neuronale, distribuite spațial în creier, sunt destinate să participe la experiența conștientă. b. Numai un mic subset dintre acestea va prelua odată manifestarea experienței conștiente.

Am constatat o schimbare semnificativă a opiniilor privind selecția naturală și rolul său în inovațiile fenotipurilor și comportamentului organismelor. Aceasta a încetat să mai aibă exclusivitate în evoluția ființelor, alte forțe au intervenit cu pretenții, cum ar fi impulsul molecular și deviația neutră, o reciclare a materialului genetic, astfel încât împreună cu selecția naturală pare că ghidează inovațiile funcționale ale organismelor.

Când și doar atunci când individul nu se limitează exclusiv la aparatul său biologic, dispune de "ceva" altceva cu care are posibilitatea să-l contureze măcar parțial, atunci și doar atunci putem susține că alege, are voință liberă. Acest "ceva" este sufletul său; în ceea ce privește natura sa, răspunsul va fi dat în următorul volum al lucrării. Diferența dintre sufletul material și cel imaterial și-a pierdut interesul, așa cum va fi explicat în volumul VI al acestei lucrări.